La technologie AWS permet à Nationwide Children's Hospital de traiter et de sécuriser les données génomiques cliniques.

Nationwide Children's Hospital (Nationwide Children's) doit relever le défi du traitement sécurisé et à grande échelle de données génomiques cliniques à forte intensité de calcul pour diagnostiquer et traiter les patients, tout en s'efforçant de mieux comprendre la génomique humaine. Nationwide Children's utilise les outils Amazon Web Services (AWS) pour le traitement et la sécurité.

Au niveau le plus élémentaire, la génomique est le langage de programmation de la vie. Cependant, comprendre les génomes humains et déterminer les variantes génomiques dans des cas cliniques spécifiques sont des tâches immensément compliquées. En 2016, Nationwide Children's a entrepris de développer non seulement la recherche en génomique, mais aussi la génomique clinique. « En contexte clinique, nous réalisons chaque année des milliers d'exomes et de panels cliniques », explique Grant Lammi, responsable du développement du cloud à The Steve and Cindy Rasmussen Institute for Genomic Medicine, qui fait partie de Nationwide Children's. Le séquençage génétique à une telle échelle nécessite une énorme puissance de calcul, et les préoccupations liées à la loi HIPAA font de la sécurité une priorité absolue. Nationwide Children's Hospital a donc développé un ensemble d'outils bio-informatiques, en grande partie sans serveur, pour faire passer en toute sécurité la génomique clinique de la préparation de l'ADN pour le séquençage à l'analyse des données de séquence d'ADN et au-delà.

Nationwide Children's s'est tourné vers AWS pour bénéficier de l'énorme puissance de calcul et l'espace de stockage dont il a besoin pour mener à bien ses travaux de génomique clinique. Le data pipeline de Nationwide Children's, développé en interne et hébergé dans le cloud, a une échelle pratiquement illimitée. Il peut donc analyser rapidement des données séquentielles et réduire le temps nécessaire pour transmettre les résultats aux patients. La sécurité étant un enjeu clé dans le traitement des données génomiques cliniques, Nationwide Children's s'est également tourné vers AWS pour obtenir des outils permettant d'intégrer la sécurité dans ses applications cloud. « Nous ne voulons pas avoir à nous soucier des correctifs à apporter aux serveurs, du suivi des exploits et de ce genre de choses », a expliqué Lammi. « Les équipes d'AWS s'en chargent. Ainsi, nous pouvons nous consacrer à la science qui est notre objectif. »